神體和神木
本殿內分為「外陣」和「內陣」，「外陣」是神職人員進行祭祀等活動的地方，最裏面的「內陣」則供奉著作為祭祀對象的「神體」。
「神體」一般仿效天皇家的「三種神器」，安置鏡子、勾玉和劍。所祀之神附體其上，而一般祭拜者是無緣一睹其真容的。
神體（三種神器）
實際上，神道原本是自然崇拜，所以也有神社將天然之物或自然現象作為「神體」來供奉，稱為「神奈備」、「磐座」、「神籬」等。
「神奈備」指的是將格外秀麗的山岳視為神山或靈山，把它們當作信仰的對象。最具代表性的有富士山（淺間神社）、白山（白山神社）、立山（雄山神社）等。
「磐座」則是信仰獨具威嚴的巨岩，視它們為神靈依附的「神體」。以Gotobiki岩（神倉神社）、三石（三石神社）、磐座（花窟神社）等為代表。
「神籬」是原始森林，將整片森林當作「鎮守之森」來崇拜，還視其中最為高大的巨樹為「神木」，作為神靈的附體之物來供奉。典型的有大楠木（蒲生八幡神社、杉桙別命神社）、龍神木（櫸樹，秩父今宮神社）等。
鹿兒島縣霧島市 鹿兒島神宮的神木
千葉縣館山市 安房神社的神木
福井縣越前町 劍神社的神木
宮城縣鹽釜市 鹽釜神社的神木
攝影：中野晴生
插圖：井塚剛
社務所
神社內還設有附屬設施「社務所」，它是神職人員和巫女工作休息之處，他們在這裏處理有關神社的各種事務，向祭拜者介紹神社和所祀神靈並受理求神者祈禱委託，在拜殿等建築前還對外授予（出售）神符、護身符、破魔箭、繪馬和神籤等。
不過在購買這些物品時，不說「買」，而是用「請」、「求」這類詞。因為它們非純粹的商品，而是崇拜信仰之物。
另外，神符上有神靈的分靈，是最重要的靈符，帶回家後，需要供奉在神龕中。伊勢神宮的神符有特殊的稱法，叫做「大麻札」。
護身符，是隨身攜帶的神符。
「破魔矢」，一如其字面意義，是一支破魔除妖的箭，通常放在家中顯眼的地方驅魔辟邪。
「繪馬」，是一塊許願用的小木牌，把你的心願寫在背面，掛在神社的指定場所，祈求得到神的庇護。
「神簽」，用來占卜凶吉，為善男信女指點迷津。
神符與護身符
破魔箭與繪馬
靜岡縣森町 小國神社的社務所
愛知縣一宮市 真清田神社的社務所
東京港區 乃木神社的社務所
攝影：中野晴生
插圖：井塚剛
裝束
神職人員的服裝和使用的道具都很有講究其，原型來自中國大陸，但遣唐使廢除後發展成獨特的風格。它們不是現代日本人的日常服裝，只有神職人員才會穿著。此外，由於長久以來神職人員都是男性擔任，所以直到最近才開始有女性服裝，它們是在男裝基礎上修改設計而成的。
正裝稱衣冠，包括頭冠、袍子和褲裙「袴」。不同等級，以不同的顏色和花紋區別。
禮服叫「祭服」，與衣冠正裝同形，但是純白無花紋的。帶有顏色和花紋的「衣冠」正裝原本是貴族官吏的服裝，「祭服」則是神職人員祭祀專用服裝，有時也可代作正裝。
日常著裝稱「狩衣」或「淨衣」。「狩衣」一如其名，是古代貴族放鷹打獵時的服裝，適於運動。它是神職人員的日常服裝，也是最為常見的裝束。著這種服裝，不戴頭冠，而是烏紗帽；褲裙的顏色因職位等級而異。「宮司」或「權宮司」等管理職位是紫色，除此之外的一般神職職位，如「禰宜」或「權禰宜」為淡青色。
此外，男性神職人員無論裝束如何，都必須手持笏板，腳穿「淺沓」。
巫女並非神職人員，只是神職人員的助手，身著的紅色褲裙「緋袴」是其標誌。她們負責處理神社各種事務性工作，不同於神職人員，無需「資格」，但一般須是未婚女性。
神職人員的正裝（特級、一級）。特級，菱形小密紋頭冠、無環藤蔓花紋黑袍、圓形八藤花紋白色織花袴。一級是圓形八藤花紋紫色織花袴
神職人員的正裝（二級上、二級）。二級上，菱形小密紋頭冠、無環藤蔓花紋紅袍、圓形藤花紋紫色織花袴二級是紫色無花平紋綢袴
神職人員的正裝（三級、四級）。疏紋頭冠、無紋綠袍、淺黃無花平紋綢袴
神職的祭服
神職的日常著裝
神職的日常著裝
巫女的正裝
神職的日常著裝
兵庫縣西宮市 西宮神社的巫女
島根縣太田市 物部神社的神職人員
攝影：中野晴生
插圖：井塚剛
